高壓制備色譜即目前常用的液相色譜。色譜柱內填裝的是粒度范圍較窄的微小顆粒固定相，為使流動相流出，需采用較高的壓力，同時系統的復雜性及成本亦增大，但分辨率可得到較大的提高。而填裝較大顆粒的固定相時，如中壓液相色譜裝柱較容易，柱的通透性較高，可采用更大的色譜柱和更經濟的儀器，由此分辨率也較低。
制備色譜是以分離出純物質為目的的色譜系統，分析色譜是以分析出樣品組分信息為目的的色譜系統，基于其目的的不同，制備色譜相對于分析色譜有很多不同特征，不能簡單等同。
當我們在實驗室中想得到納克乃至毫克級的純物質時，稍微改裝下分析型色譜系統就能簡單輕松的完成，不過若所需制備的純品量很大，此時再用分析型色譜系統分離純化，這便走進了“誤區”之中。
制備色譜常用的色譜模式有低、中、高壓三種，以應對不同類型和不同純度要求的樣品的分離，同時盡可能減少成本。
在開發高壓制備色譜方法時，很多人都存在這樣的錯誤認識，認為制備色譜的流動相純度不需要優先考慮，分析用色譜純，制備馬馬虎虎就行了，不過我們從另一方面思考下，制備過程中流動相的使用量一般都很大，其中的雜質積聚后，對產品的純度影響將會十分可觀，因此，對于雜質的流向需要與純化過程關聯起來，使用純度較高的流動相是必要的。
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